System LC-MS składa się z wysokorozdzielczego spektrometru mas z analizatorem typu orbitrap połączonego z chromatografem cieczowym (LC-MS). Ten nowoczesny sprzęt został kupiony przez Uniwersytet Jagielloński w ramach projektu „Centrum Rozwoju Terapii Chorób Cywilizacyjnych i Związanych z Wiekiem”.
Sercem technologicznym współczesnych badań proteomicznych stały się spektrometry mas. Nowoczesne metody analizy składu białek i ich strukturalnych modyfikacji opierają się obecnie wyłącznie na instrumentach wysokorozdzielczych. Nowatorskie metody oznaczeń proteomicznych stanowią o sile nowoczesnych badań nad mechanizmami rozwoju przewlekłych chorób cywilizacyjnych, będących osiowym zainteresowaniem badawczym Centrum Rozwoju Terapii Chorób Cywilizacyjnych i Związanych z Wiekiem. Uruchomiony w ramach Centrum spektrometr Orbitrap Exploris 480 (Thermo Scientific) spełnia wszelkie wymagania techniczne niezbędne do prowadzenia analiz białek o wysokiej jakości naukowej.
Analizator typu orbitrap zastosowany w tym urządzeniu pozwala na osiągnięcie najwyższej w swojej klasie rozdzielczości uzyskiwanych widm masowych do wartości 480 000. Ponadto częstotliwość pomiarowa oraz konstrukcja ścieżki jonowej wewnątrz spektrometru pozwala na wdrożenie wszystkich metod analitycznych używanych obecnie w laboratoriach proteomicznych na świecie, zarówno klasycznych (DDA, PRM), nowych (DIA, tzw. Next Generation Proteomics) jak również tych nowatorskich i prototypowych (single cell proteomics), niezbędnych do realizacji celów badawczych CDT-CARD.
Zakupiony instrument Exploris 480 jest wyposażony w analizator ruchliwości jonowej (FAIMS Pro), oferując dodatkowy ortogonalny wymiar analizy spektrometrycznej. W efekcie, dzięki redukcji szumu i efektów matrycowych zastosowanie FAIMS Pro zwiększa selektywność i czułość analiz proteomicznych.
Fot. Aneta Sitek, Uniwersytet Jagielloński, Centrum Rozwoju Terapii Chorób Cywilizacyjnych i Związanych z Wiekiem